1・宮中で祭られていた天照大神と倭大国魂大神

　『日本書紀』によれば崇神天皇五年に疫病が流行り、翌六年には天皇の大殿で並祭されていた天照大神と、倭大国魂（やまとおおくにたま）の二神が、天照大神には豊鍬入姫命（とよすきいりひめのみこと）を、倭大国魂大神には渟名城入姫命（ぬなきのいりひめのみこと）をそれぞれ付けて、そこから出されたといいます。

　天照大神は伊勢神宮の内宮で、倭大国魂大神は、大和神社（おおやまとじんじゃ）で祭られている神です。先述しましたが、天照大神は『三輪大明神縁起』では下界にはまず、大和国の三輪山へ降臨したということから、大神神社の神だとも分かります。
　伊勢神宮へのご鎮座はこの後、垂仁天皇の時代に豊鍬入姫命から受継いだ倭姫命（やまとひめのみこと）が、伊勢国の五十鈴川の辺りに斎宮を建てたのを起源とするといいます。これは一説には垂仁天皇二十六年の事と『日本書紀』にあり、この時「天照大神がはじめて天より降られたところである」と不思議な文言をも記します。
　「はじめて天より降られたところ」が、伊勢国であったのなら、宮中は地上ではないのかと言う疑問は置きまして、大神神社の文献や話の流れを取るのなら、どちらの天照大神も同一神だとしたら、崇神天皇即位以前より宮中で奉斎されていたことになります。

　天照大神は、大神神社の文献、例えば『大三輪社勘文』では孝昭天皇元年に三輪山に降臨したとみえます。大神神社の神は大己貴神（おおなむちのかみ）の幸魂奇魂（さきみたまくしみたま）という、大物主神（おおものぬしのかみ）ですので、これが最初に降臨したという天照大神になります。
　『出雲国造神賀詞』（いずものくにのみやつこかんよごと）には、大穴持命の和魂を「八咫鏡に取り託けて」とありますが、八咫鏡といえば、伊勢内宮の神宝であるのは周知のことです。
　幸魂奇魂とは、和魂ですがこれと対となるのが荒御魂です。大神神社の神は大己貴神の幸魂奇魂ですが、荒御魂は大和神社の倭大国魂大神となります。言い換えればこれは、天照大神の和魂、荒御魂となります。倭大国魂大神こと大己貴神の荒御魂も、孝昭天皇元年に天皇の大殿に祭られたのをその起源とします。

　著者の見解では、孝昭天皇が初代天皇となりますが、ここから見えるのはどちらも初代天皇の元年より宮中で祭られていたとなります。

2・倭大国魂大神と「水神」